PyMOL

PyMol是专为研究不同物质分子模型的科学家设计的高端工具。此运用为开源程序，功能极其完善，不适用与初学者。其中包含：分子结合与分裂，任意选择原子，提供高品质图片等。

在操作PyMol时，你可能需要同时使用图形用户界面和命令行。在运用程序菜单中，你需要设置大量的选项，如：放大，标签，颜色等等。

在PyMol中，比较有趣的功能是你可以把项目中带电的分子结构运动制作成电影。如果你经常执行任务，PyMol会提供脚本来避免你重复做相同的步骤。

PyMol图像功能使用“内置光线”技术，能全方面生成深层次图形。图片格式为PNG。